En un post Anterior comente sobre un problema de parpadeo que tenemos al instalar los drivers ATI 8.12.
Explicare la forma mas sencilla con la cual podemos deshacernos de este problema con VLC, debo decir que esto solo lo he probado con Intrepid, bajo drivers ATI 8.12 privativos, pero supongo que funcinará para cualquier distrito.

Como primer paso abrimos el VLC, damos click en la barra de menú Herramientas, en el menú contextual seleccionamos Preferencias y nos abre una ventana similar a esta:

Después nos vamos a la opción vídeo y nos mostrara la misma ventana que veremos a continuación :

Nos hubicamos donde esta el puntero de la imagen, que es la opción salida y seleccionamos Salida de video X11, damos click en salvar, cerramos el VLC y ya podemos reproducir vídeos sin este molesto parpadeo.